我學(xué)者實(shí)現(xiàn)生物DNA分子存儲醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)
科技日報(bào)訊 (記者羅云鵬 通訊員祝孔倩)6月30日,記者從中國科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院獲悉,該院先進(jìn)計(jì)算與數(shù)字工程研究所研究員姜青山、合成生物學(xué)研究所高級工程師黃小羅,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員戴俊彪等設(shè)計(jì)出一種名為“EDS”的DNA存儲方法,實(shí)現(xiàn)了醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)在生物DNA分子中的存儲。相關(guān)研究成果發(fā)表于《小方法》雜志。
醫(yī)學(xué)磁共振成像(MRI)數(shù)據(jù)對疾病診斷、治療和監(jiān)測等具有重要意義,利用DNA存儲技術(shù)保存醫(yī)學(xué)MRI數(shù)據(jù)有助于人類健康管理。DNA存儲可確保重要數(shù)據(jù)在數(shù)千年內(nèi)安全保存并精確恢復(fù),為研究疾病進(jìn)展和治療效果提供重要數(shù)據(jù)支撐。
科研團(tuán)隊(duì)通過改進(jìn)編碼模型、引入冗余核苷酸和設(shè)計(jì)索引技術(shù),實(shí)現(xiàn)MRI數(shù)據(jù)可靠歸檔和檢索。基于此,團(tuán)隊(duì)將編碼任務(wù)分解成多個(gè)子任務(wù),并分配多個(gè)CPU進(jìn)行并行計(jì)算,實(shí)現(xiàn)編碼速率提高。科研團(tuán)隊(duì)共測試人體MRI數(shù)據(jù)72GB,僅用9個(gè)小時(shí)就完成編碼。團(tuán)隊(duì)據(jù)此預(yù)測,1TB量級數(shù)據(jù)可以在120小時(shí)內(nèi)完成編碼。
“下一步,我們將繼續(xù)深化DNA存儲核心技術(shù)研發(fā),同時(shí)推動DNA存儲與磁帶、光盤等傳統(tǒng)存儲工具結(jié)合,為更多數(shù)據(jù)存儲應(yīng)用提供技術(shù)基礎(chǔ),加快DNA存儲面向?qū)嶋H應(yīng)用的產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程。”姜青山說。