新冠病毒精確完整基因注釋圖譜完成
美國麻省理工學(xué)院的科學(xué)家在11日出版的《自然·通訊》雜志撰文稱,在進行了廣泛的比較基因組學(xué)研究之后,他們繪制出了新冠病毒迄今最精確完整的基因注釋圖譜,確認(rèn)了幾種蛋白質(zhì)編碼基因,也發(fā)現(xiàn)有些基因并不編碼任何蛋白質(zhì)。此外,他們還分析了新冠病毒不同毒株產(chǎn)生的近2000個突變,從而能更好地評估這些突變的重要性。
新冠病毒的基因組由近30000個RNA堿基組成。此前科學(xué)家已經(jīng)根據(jù)與相關(guān)病毒中蛋白質(zhì)編碼基因的相似性,確定了一些能編碼蛋白質(zhì)的基因。他們認(rèn)為,另外還有些基因能編碼蛋白質(zhì),但它們并沒有明確歸類為蛋白質(zhì)編碼基因。
為確定這些蛋白質(zhì)編碼基因,計算機科學(xué)和人工智能實驗室的瑪諾里斯·克里斯教授領(lǐng)導(dǎo)的實驗團隊利用自己開發(fā)出的計算技術(shù),對新冠病毒、薩斯病毒和42株蝙蝠沙貝病毒亞屬進行了分析。這一技術(shù)的基本原理是分析物種之間是否保存著某些DNA或RNA堿基,并比較它們隨時間如何進化,他們此前已利用該技術(shù)比較了人類基因組與其它哺乳動物的基因組。
結(jié)果表明,除發(fā)現(xiàn)此前已在其他冠狀病毒中發(fā)現(xiàn)的5個基因外,克里斯團隊還確認(rèn)了新冠病毒基因組中6個蛋白質(zhì)編碼基因,而其他5個被認(rèn)為能編碼蛋白的基因并無此能力。他們表示,在分析了整個基因組后,非常確信沒有其他蛋白質(zhì)編碼基因成為“漏網(wǎng)之魚”。他們計劃繼續(xù)開展實驗研究,以弄清這些沒有特征的基因的功能。
此外,克里斯團隊還分析了自新冠病毒首次被發(fā)現(xiàn)以來,已經(jīng)出現(xiàn)的1800多個突變,并比較了每個基因在過去的進化速度和疫情暴發(fā)以來的進化速度。結(jié)果表明,大多數(shù)情況下,在疫情暴發(fā)之前長時間快速進化的基因仍在繼續(xù)快速進化,而緩慢進化的基因也保持著自身的節(jié)奏。不過也有例外,這可能有助于揭示病毒在適應(yīng)新的人類宿主時是如何進化的。
研究人員還分析了幾種新冠病毒變異毒株——B.1.1.7、P.1和B.1.351等出現(xiàn)的突變。結(jié)果發(fā)現(xiàn),許多使這些變異更危險的突變存在于刺突蛋白中,有助于病毒更快地傳播并避開免疫系統(tǒng)。他們指出,每個變異毒株都擁有20多個獨特的突變,知道哪些可能有用,哪些無用非常重要,有助于科學(xué)家專注最有可能對病毒傳染性產(chǎn)生重大影響的突變。
總編輯圈點
病毒是什么?新冠病毒又有何特殊?早在1977年,生物學(xué)家就告訴我們病毒“只是包裹在蛋白質(zhì)中的一條遺傳信息”,病毒必須感染進入活細(xì)胞才能進行復(fù)制和傳播。因此,當(dāng)新冠病毒找到合適的細(xì)胞時,它也會注入一條包含整個基因組的RNA鏈,科學(xué)家對其基因圖譜的分析,提供了一條了解新冠病毒蛋白的途徑。但這其中,有的蛋白質(zhì)功能未知,有的蛋白質(zhì)可能無用,此次的研究成果就是在完善人們的認(rèn)知,其有利于改善診斷技術(shù)、開發(fā)新的治療藥物,同時,也使我們推斷出這場疫情里更多特征,實時跟蹤其傳播和變異。(記者劉霞)
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